Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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MED27Q6P2C8 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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MED27Q6P2C8 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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