Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms