Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PXDC1Q5TGL8 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PXDC1Q5TGL8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PXDC1Q5TGL8 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PXDC1Q5TGL8 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PXDC1Q5TGL8 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PXDC1Q5TGL8 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PXDC1Q5TGL8 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PXDC1Q5TGL8 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PXDC1Q5TGL8 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PXDC1Q5TGL8 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PXDC1Q5TGL8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PXDC1Q5TGL8 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PXDC1Q5TGL8 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PXDC1Q5TGL8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PXDC1Q5TGL8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PXDC1Q5TGL8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PXDC1Q5TGL8 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PXDC1Q5TGL8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PXDC1Q5TGL8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PXDC1Q5TGL8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PXDC1Q5TGL8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PXDC1Q5TGL8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PXDC1Q5TGL8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PXDC1Q5TGL8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PXDC1Q5TGL8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PXDC1Q5TGL8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PXDC1Q5TGL8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PXDC1Q5TGL8 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PXDC1Q5TGL8 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PXDC1Q5TGL8 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PXDC1Q5TGL8 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PXDC1Q5TGL8 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PXDC1Q5TGL8 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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PXDC1Q5TGL8 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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PXDC1Q5TGL8 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PXDC1Q5TGL8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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