Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms