Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms