Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms