Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAY7

SMU1, WD40 repeat-containing protein SMU1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMU1Q2TAY7 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMU1Q2TAY7 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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