Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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