Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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