Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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GABRA6Q16445 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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GABRA6Q16445 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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GABRA6Q16445 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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