Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF2Q15853 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
USF2Q15853 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
USF2Q15853 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
USF2Q15853 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
USF2Q15853 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
USF2Q15853 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
USF2Q15853 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF2Q15853 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF2Q15853 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF2Q15853 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF2Q15853 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF2Q15853 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF2Q15853 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF2Q15853 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF2Q15853 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF2Q15853 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF2Q15853 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF2Q15853 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF2Q15853 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
USF2Q15853 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF2Q15853 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF2Q15853 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF2Q15853 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF2Q15853 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF2Q15853 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF2Q15853 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF2Q15853 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF2Q15853 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF2Q15853 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF2Q15853 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF2Q15853 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF2Q15853 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF2Q15853 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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