Protein–RNA interactions for Protein: Q15772

SPEG, Striated muscle preferentially expressed protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 3,267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEGQ15772 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
SPEGQ15772 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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