Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
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