Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms