Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IKZF1Q13422 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms