Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFCP2Q12800 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFCP2Q12800 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFCP2Q12800 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFCP2Q12800 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFCP2Q12800 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFCP2Q12800 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFCP2Q12800 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFCP2Q12800 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFCP2Q12800 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFCP2Q12800 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFCP2Q12800 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFCP2Q12800 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFCP2Q12800 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFCP2Q12800 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFCP2Q12800 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFCP2Q12800 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFCP2Q12800 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFCP2Q12800 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFCP2Q12800 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFCP2Q12800 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFCP2Q12800 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFCP2Q12800 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFCP2Q12800 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFCP2Q12800 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TFCP2Q12800 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFCP2Q12800 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFCP2Q12800 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFCP2Q12800 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFCP2Q12800 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFCP2Q12800 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFCP2Q12800 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFCP2Q12800 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms