Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms