Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms