Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms