Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms