Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms