Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms