Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSG1P42857 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSG1P42857 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSG1P42857 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSG1P42857 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSG1P42857 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSG1P42857 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSG1P42857 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSG1P42857 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSG1P42857 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSG1P42857 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSG1P42857 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NSG1P42857 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSG1P42857 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSG1P42857 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSG1P42857 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSG1P42857 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSG1P42857 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSG1P42857 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSG1P42857 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSG1P42857 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSG1P42857 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSG1P42857 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSG1P42857 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSG1P42857 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSG1P42857 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSG1P42857 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSG1P42857 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSG1P42857 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSG1P42857 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSG1P42857 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSG1P42857 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSG1P42857 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSG1P42857 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSG1P42857 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSG1P42857 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NSG1P42857 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSG1P42857 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSG1P42857 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NSG1P42857 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSG1P42857 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSG1P42857 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSG1P42857 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSG1P42857 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSG1P42857 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSG1P42857 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSG1P42857 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSG1P42857 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSG1P42857 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms