Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFNP31947 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFNP31947 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFNP31947 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SFNP31947 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFNP31947 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFNP31947 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFNP31947 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFNP31947 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFNP31947 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFNP31947 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFNP31947 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFNP31947 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFNP31947 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFNP31947 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFNP31947 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFNP31947 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SFNP31947 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFNP31947 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFNP31947 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFNP31947 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFNP31947 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFNP31947 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFNP31947 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFNP31947 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFNP31947 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFNP31947 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFNP31947 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFNP31947 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFNP31947 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFNP31947 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFNP31947 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFNP31947 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SFNP31947 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFNP31947 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SFNP31947 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFNP31947 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFNP31947 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFNP31947 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFNP31947 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFNP31947 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFNP31947 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFNP31947 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFNP31947 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFNP31947 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFNP31947 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFNP31947 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFNP31947 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFNP31947 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SFNP31947 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFNP31947 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFNP31947 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFNP31947 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFNP31947 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFNP31947 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFNP31947 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFNP31947 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFNP31947 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFNP31947 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFNP31947 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFNP31947 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFNP31947 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFNP31947 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFNP31947 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFNP31947 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFNP31947 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFNP31947 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFNP31947 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFNP31947 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SFNP31947 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SFNP31947 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFNP31947 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFNP31947 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFNP31947 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SFNP31947 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFNP31947 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFNP31947 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFNP31947 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFNP31947 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFNP31947 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFNP31947 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFNP31947 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFNP31947 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFNP31947 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFNP31947 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFNP31947 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SFNP31947 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFNP31947 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFNP31947 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFNP31947 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFNP31947 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFNP31947 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFNP31947 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFNP31947 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SFNP31947 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFNP31947 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFNP31947 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFNP31947 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFNP31947 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SFNP31947 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms