Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSSP25774 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSSP25774 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSSP25774 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSSP25774 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSSP25774 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSSP25774 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSSP25774 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSSP25774 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSSP25774 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSSP25774 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSSP25774 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSSP25774 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSSP25774 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSSP25774 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSSP25774 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CTSSP25774 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CTSSP25774 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSSP25774 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSSP25774 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSSP25774 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSSP25774 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSSP25774 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSSP25774 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSSP25774 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSSP25774 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSSP25774 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSSP25774 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSSP25774 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSSP25774 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSSP25774 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSSP25774 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSSP25774 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSSP25774 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSSP25774 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSSP25774 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSSP25774 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CTSSP25774 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTSSP25774 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTSSP25774 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTSSP25774 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTSSP25774 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CTSSP25774 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTSSP25774 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CTSSP25774 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTSSP25774 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CTSSP25774 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTSSP25774 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTSSP25774 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTSSP25774 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CTSSP25774 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CTSSP25774 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTSSP25774 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTSSP25774 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTSSP25774 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTSSP25774 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CTSSP25774 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTSSP25774 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTSSP25774 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTSSP25774 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTSSP25774 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTSSP25774 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTSSP25774 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTSSP25774 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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