Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGS1P23219 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms