Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BGNP21810 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BGNP21810 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BGNP21810 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BGNP21810 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BGNP21810 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BGNP21810 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BGNP21810 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BGNP21810 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BGNP21810 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BGNP21810 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BGNP21810 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BGNP21810 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BGNP21810 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BGNP21810 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BGNP21810 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BGNP21810 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BGNP21810 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BGNP21810 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BGNP21810 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BGNP21810 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BGNP21810 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BGNP21810 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BGNP21810 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BGNP21810 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BGNP21810 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BGNP21810 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BGNP21810 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BGNP21810 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BGNP21810 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BGNP21810 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BGNP21810 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BGNP21810 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BGNP21810 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BGNP21810 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BGNP21810 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BGNP21810 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BGNP21810 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BGNP21810 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BGNP21810 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BGNP21810 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BGNP21810 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BGNP21810 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BGNP21810 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BGNP21810 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BGNP21810 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BGNP21810 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BGNP21810 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BGNP21810 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BGNP21810 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BGNP21810 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms