Protein–RNA interactions for Protein: P15328

FOLR1, Folate receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOLR1P15328 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOLR1P15328 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FOLR1P15328 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOLR1P15328 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOLR1P15328 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOLR1P15328 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOLR1P15328 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOLR1P15328 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOLR1P15328 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOLR1P15328 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOLR1P15328 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOLR1P15328 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOLR1P15328 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOLR1P15328 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOLR1P15328 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOLR1P15328 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOLR1P15328 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOLR1P15328 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOLR1P15328 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOLR1P15328 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOLR1P15328 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOLR1P15328 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOLR1P15328 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOLR1P15328 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOLR1P15328 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FOLR1P15328 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FOLR1P15328 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOLR1P15328 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOLR1P15328 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOLR1P15328 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOLR1P15328 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOLR1P15328 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOLR1P15328 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOLR1P15328 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOLR1P15328 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms