Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms