Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CFTRP13569 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFTRP13569 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFTRP13569 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFTRP13569 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFTRP13569 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFTRP13569 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFTRP13569 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CFTRP13569 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CFTRP13569 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CFTRP13569 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CFTRP13569 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CFTRP13569 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CFTRP13569 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CFTRP13569 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CFTRP13569 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CFTRP13569 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CFTRP13569 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CFTRP13569 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CFTRP13569 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CFTRP13569 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CFTRP13569 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CFTRP13569 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CFTRP13569 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CFTRP13569 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CFTRP13569 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CFTRP13569 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFTRP13569 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFTRP13569 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFTRP13569 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFTRP13569 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFTRP13569 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFTRP13569 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFTRP13569 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFTRP13569 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CFTRP13569 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFTRP13569 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CFTRP13569 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CFTRP13569 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFTRP13569 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFTRP13569 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFTRP13569 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFTRP13569 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFTRP13569 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFTRP13569 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFTRP13569 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFTRP13569 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFTRP13569 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFTRP13569 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFTRP13569 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CFTRP13569 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFTRP13569 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFTRP13569 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFTRP13569 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFTRP13569 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFTRP13569 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFTRP13569 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFTRP13569 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFTRP13569 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFTRP13569 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFTRP13569 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFTRP13569 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFTRP13569 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFTRP13569 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFTRP13569 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFTRP13569 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFTRP13569 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFTRP13569 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFTRP13569 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFTRP13569 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CFTRP13569 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFTRP13569 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFTRP13569 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFTRP13569 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFTRP13569 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFTRP13569 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFTRP13569 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFTRP13569 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFTRP13569 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFTRP13569 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFTRP13569 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFTRP13569 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFTRP13569 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFTRP13569 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFTRP13569 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFTRP13569 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFTRP13569 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFTRP13569 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFTRP13569 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFTRP13569 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFTRP13569 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFTRP13569 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFTRP13569 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFTRP13569 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CFTRP13569 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFTRP13569 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CFTRP13569 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFTRP13569 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFTRP13569 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFTRP13569 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms