Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPBP07199 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPBP07199 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPBP07199 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPBP07199 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPBP07199 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPBP07199 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPBP07199 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPBP07199 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPBP07199 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPBP07199 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPBP07199 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPBP07199 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPBP07199 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPBP07199 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPBP07199 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPBP07199 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPBP07199 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPBP07199 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPBP07199 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPBP07199 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPBP07199 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPBP07199 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPBP07199 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPBP07199 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPBP07199 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPBP07199 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPBP07199 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPBP07199 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPBP07199 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPBP07199 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPBP07199 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPBP07199 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPBP07199 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPBP07199 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPBP07199 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPBP07199 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPBP07199 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPBP07199 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPBP07199 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPBP07199 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPBP07199 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPBP07199 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPBP07199 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPBP07199 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPBP07199 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPBP07199 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPBP07199 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPBP07199 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPBP07199 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPBP07199 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPBP07199 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPBP07199 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPBP07199 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPBP07199 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPBP07199 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPBP07199 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPBP07199 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPBP07199 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPBP07199 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPBP07199 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPBP07199 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPBP07199 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPBP07199 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPBP07199 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPBP07199 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPBP07199 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPBP07199 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPBP07199 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPBP07199 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPBP07199 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPBP07199 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPBP07199 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPBP07199 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPBP07199 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPBP07199 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPBP07199 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPBP07199 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPBP07199 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPBP07199 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPBP07199 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPBP07199 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPBP07199 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPBP07199 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPBP07199 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPBP07199 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPBP07199 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPBP07199 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPBP07199 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPBP07199 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPBP07199 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPBP07199 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPBP07199 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPBP07199 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPBP07199 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPBP07199 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPBP07199 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPBP07199 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPBP07199 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPBP07199 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms