Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms