Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms