Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DXG7 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DXG7 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DXG7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DXG7 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DXG7 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DXG7 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DXG7 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DXG7 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DXG7 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DXG7 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DXG7 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DXG7 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DXG7 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DXG7 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DXG7 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DXG7 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DXG7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DXG7 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DXG7 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DXG7 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DXG7 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DXG7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DXG7 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DXG7 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DXG7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DXG7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DXG7 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DXG7 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DXG7 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DXG7 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DXG7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DXG7 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DXG7 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DXG7 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DXG7 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DXG7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DXG7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DXG7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DXG7 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DXG7 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DXG7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DXG7 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DXG7 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DXG7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DXG7 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DXG7 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DXG7 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DXG7 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DXG7 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DXG7 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DXG7 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DXG7 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DXG7 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DXG7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DXG7 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DXG7 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DXG7 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DXG7 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DXG7 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DXG7 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DXG7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DXG7 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DXG7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DXG7 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DXG7 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DXG7 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DXG7 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DXG7 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DXG7 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DXG7 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DXG7 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DXG7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DXG7 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DXG7 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DXG7 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DXG7 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DXG7 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DXG7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DXG7 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DXG7 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DXG7 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DXG7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DXG7 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DXG7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DXG7 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DXG7 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DXG7 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DXG7 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DXG7 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DXG7 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DXG7 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DXG7 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DXG7 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DXG7 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DXG7 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DXG7 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DXG7 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DXG7 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DXG7 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms