Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms