Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
C9orf92A6NGG3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms