Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms