Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN8

Uncharacterized protein ENSP00000372125, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NCN8 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A6NCN8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A6NCN8 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A6NCN8 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A6NCN8 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A6NCN8 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
A6NCN8 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A6NCN8 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
A6NCN8 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A6NCN8 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A6NCN8 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A6NCN8 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A6NCN8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A6NCN8 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A6NCN8 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A6NCN8 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A6NCN8 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A6NCN8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
A6NCN8 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A6NCN8 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A6NCN8 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A6NCN8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A6NCN8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A6NCN8 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NCN8 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NCN8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NCN8 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NCN8 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NCN8 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NCN8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NCN8 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NCN8 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NCN8 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NCN8 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NCN8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NCN8 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NCN8 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NCN8 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NCN8 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NCN8 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NCN8 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NCN8 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NCN8 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NCN8 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NCN8 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NCN8 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NCN8 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NCN8 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NCN8 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NCN8 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NCN8 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NCN8 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NCN8 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NCN8 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NCN8 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NCN8 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NCN8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NCN8 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NCN8 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NCN8 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NCN8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NCN8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NCN8 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NCN8 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NCN8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NCN8 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A6NCN8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A6NCN8 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
A6NCN8 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A6NCN8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A6NCN8 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A6NCN8 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NCN8 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NCN8 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NCN8 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NCN8 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NCN8 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NCN8 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NCN8 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NCN8 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NCN8 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NCN8 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NCN8 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NCN8 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NCN8 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NCN8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NCN8 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NCN8 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NCN8 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NCN8 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NCN8 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NCN8 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NCN8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NCN8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NCN8 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NCN8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NCN8 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NCN8 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NCN8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NCN8 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms