Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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