Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.1 ms