Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms