Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms