Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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