Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM31Q9BZY9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms