Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NSD3Q9BZ95 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms