Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNPPD1Q9BV87 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNPPD1Q9BV87 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNPPD1Q9BV87 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CNPPD1Q9BV87 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNPPD1Q9BV87 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNPPD1Q9BV87 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNPPD1Q9BV87 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNPPD1Q9BV87 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNPPD1Q9BV87 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNPPD1Q9BV87 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNPPD1Q9BV87 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNPPD1Q9BV87 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNPPD1Q9BV87 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNPPD1Q9BV87 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNPPD1Q9BV87 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNPPD1Q9BV87 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CNPPD1Q9BV87 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNPPD1Q9BV87 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNPPD1Q9BV87 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNPPD1Q9BV87 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNPPD1Q9BV87 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNPPD1Q9BV87 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNPPD1Q9BV87 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNPPD1Q9BV87 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNPPD1Q9BV87 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNPPD1Q9BV87 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNPPD1Q9BV87 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNPPD1Q9BV87 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNPPD1Q9BV87 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNPPD1Q9BV87 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNPPD1Q9BV87 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNPPD1Q9BV87 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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