Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms