Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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