Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms