Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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